Lisbeth ist für ein Jahr im Ausland gewesen und kehrt nun nach Schweden zurück. Mikael ist in dieser Zeit mit einem neuen Projekt befasst, welches sich mit Mädchenhandel beschäftigt. Ein freier Journalist hat ein Buch über dieses Thema verfasst und will mit "Millenium" parallel zur Buchveröffentlichung eine Ausgabe mit derselben Thematik herausbringen.
Offensichtlich sind in den Mädchenhandelskandal auch Polizisten, teilweise von der Sicherheitspolizei verwickelt und der Stoff birgt ziemlichen Sprengstoff. Die Betroffenen soll die Gelegenheit gegeben zu werden, dazu Stellung zu beziehen. Dies ist der Anfang einer Kettenreaktion, die sich über mehrere Ebenen erstreckt.
Dag Svensson, der freie Journalist und seine Freundin Mia werden bald tot aufgefunden. Kurz darauf auch der Rechtsanwalt Bjurman, Lisbeths Vormund, der sie im ersten Band mehrfach gedemütigt und zuletzt brutal vergewaltigt hatte.
Bei dem Pärchen wird eine Waffe mit den Fingerabdrücken von Lisbeth gefunden. Sofort ist sie die Hauptverdächtige und sie landet auf der Fahndungsliste. Nachdem auch klar wird, welche Verbindung zwischen ihr und Bjurman besteht, wird ihr auch dieser Mord zur Last gelegt.
Mikael, der Dag und Mia tot aufgefunden hat, bezweifelt jedoch die Schuld von Lisbeth und beginnt, auf eigene Faust, Ermittlungen anzustellen. Auch Dragan Armanskij, Lisbeths ehemaliger Chef bei Milton Security glaubt nicht an diesen Verdacht und stellt einige seiner Leute der Polizei zur Verfügung.

So werden verschiedene Ermittlungsstränge aufgemacht und auch aus Lisbeths Sicht sieht man die Ereignisse und kann sich nach und nach eigene Vorstellungen machen.
Das Ende dieses 2. Teils ist kein wirkliches Ende. Zwar sind viele Fakten geklärt, doch ob Lisbeth ihre Unschuld beweisen kann, ist erst Bestandteil des letzten Bandes
Eine gelungene Fortsetzung, nach der man den letzten Band unbedingt lesen muss.